张锋团队揭示新型基因编辑工具的结构和作用机制

时间:2023-10-06 15:36:02 来源:网友投稿

2021年,美国博德研究所张锋团队确定了一类新的RNA引导基因编辑系统,将之称为OMEGA,并认为Cas9是从IscB蛋白进化而来,但IscB的功能及其与RNA的相互作用尚不明确。近期,该团队利用低温电子显微镜揭示了脱硫弧菌IsrB(Desulfovirgula thermocuniculi IsrB,DtIsrB)与其同源ωRNA和靶DNA复合体结构。研究成果发表在2022年10月12日《自然》期刊,其中IsrB的DNA靶向和粘附机制见下图。

RNA引导的基因编辑系统,如CRISPR-Cas,将可编程底物识别与酶功能相结合,这种组合作为一种分子技术已得到有效应用。这些系统的结构研究阐明了RNA和蛋白质如何共同识别和切割其底物,还可以进一步指导合理的工程技术开发。OMEGA系统包括IscB和缺少HNH核酸酶结构域的IscB同源物——IsrB内切酶。IsrB可能是IscB的前身,是另一个OMEGA家族成员,仅由大约350个氨基酸组成,但其较小的体积与相对较大的ωRNA(大约300nt)引导相匹配。研究团队发现,IsrB蛋白的整体结构与Cas9具有共同骨架。然而,与使用识别部分(REC)来促进目标选择的Cas9相比,IsrB依赖于ωRNA,其中一部分形成类似于REC的复杂三元结构。IsrB及其ωRNA的结构分析以及与其他RNA引导系统的比较突出了蛋白质和RNA之间的功能互作,促进了人类对这些不同系统的生物学和进化的理解。未来对IsrB在其他构象中的结构研究将进一步加深人类对OMEGA这类新的可编程基因编辑系统的机制认识。

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